小智一行人正要前往橘子聯(lián)盟舉辦的比賽島嶼的途中，他們?cè)诤Ｉ险J(rèn)識(shí)了開船旅行的訓(xùn)練家小美，並且受到小美的邀請(qǐng)，來(lái)到她的遊艇上，繼續(xù)旅行，朝下一個(gè)小島前進(jìn)。
突然，他們?cè)獾搅孙L(fēng)暴，衝上了橘子群島中心的亞西亞島。
小美就在這裏遇到了老朋友小優(yōu)，而島上正好有祭典。
聽到小智是寶可夢(mèng)訓(xùn)練家時(shí)，那些居民們歡唿雀躍，說(shuō)是傳說(shuō)中，跟著世界的毀滅，海之神的出現(xiàn)，並與優(yōu)秀的指揮者一起平息諸神的憤怒。
指揮者就是訓(xùn)練家。
很明顯那些居民們將小智認(rèn)為是這個(gè)優(yōu)秀的指揮者。而這個(gè)祭典的聖女——芙蘆拉親了下小智。
小霞在一旁看到了這一幕，她都炸毛了！
.......
觀影的眾人一驚，這個(gè)是真的嗎？
小智居然被親了，最激動(dòng)的不是小智，而是莎莉娜她們。
那女孩是怎麼一迴事？
花子既是疑惑，又是開心，片刻後，又哀愁了下來(lái)。
因?yàn)楣饽谎Y的小智還是呆呆的，不知所措，對(duì)這個(gè)女孩沒什麼表示，而且旁邊的小霞都快炸毛了，也不說(shuō)了句安慰一下。
【小剛：？】
此時(shí)的小剛睜大眼睛看著白光幕，光天化日之下竟然這麼大膽親小智，道德在哪裏，良心在哪裏，還有地址在哪裏？
【小茂：可惡，小智這個(gè)家夥有女孩子親他，我是真沒想到呀！】
【莎莉娜：什麼嘛，什麼慣例！】
【芙蘆拉：抱歉抱歉，那不是慣例！】
【莎莉娜：還不是慣例？難不成你對(duì)小智？】
【薩琪：看來(lái)有人比你還要快動(dòng)手，你要抓緊呀！】
【莎莉娜：媽，你別說(shuō)話了！】
莎莉娜俏臉紅撲撲的，都不敢看向小智了，老媽也真是的，明知道自己臉皮薄，還要這樣揶揄自己，她不要麵子的嗎？
就不能讓她少在喜歡的人麵前出醜嗎？
【牡丹：別說(shuō)了，小霞都快要炸毛了！】
【小霞：你才炸毛，別扯上我。】
【菖蒲：嘖嘖，看看白光幕的自己吧，從你臉上就可以看出了！】
【櫻花：妹夫，你也不說(shuō)說(shuō)話安慰一下小霞！】
咋這麼大反應(yīng)呢，小智已經(jīng)對(duì)妹夫這個(gè)稱號(hào)免疫了，說(shuō)了她們還要繼續(xù)喊，他也沒有辦法，隻好順從唄！
【小智：我也不知道說(shuō)什麼。】
【大木博士：迴頭讓小茂教你點(diǎn)東西。】
【花子：這個(gè)可以！！！】
.......
白世界的小智一行跟居民們一起舉辦這個(gè)宴會(huì)。
而小霞就化悲憤為力量，但芙蘆拉換了一身服裝，吹奏笛子，上前握住了小智的手臂，小霞的臉色很不好。
很多人都認(rèn)為小霞是吃醋了。
至少是小霞的三個(gè)姐姐是這樣認(rèn)為的，還在小霞耳邊嗡嗡嗡地說(shuō)著。
小霞臉紅耳赤，自己再怎麼說(shuō)好像也不管用，那幹脆就不說(shuō)了吧。
而此時(shí)的小剛則是感覺後悔萬(wàn)分，自己居然錯(cuò)過了，這個(gè)島上有這麼多漂亮的姐姐。
他看得出來(lái)，芙蘆拉對(duì)小智不一般，感覺不簡(jiǎn)單。
白小智得知了要到三聖鳥的島嶼取迴三個(gè)寶物，將它們帶迴神廟，芙蘆拉則會(huì)在那裏吹響笛子，那即刻解決。
雷厲風(fēng)行的小智立馬就要開船過去，很快就找到了火焰鳥的寶物，但被火箭隊(duì)所幹?jǐn)_。
小霞她們則是乘坐小美的船抵達(dá)，恰好這個(gè)時(shí)候閃電鳥出現(xiàn)，它是想要趁火焰鳥不在，霸占這個(gè)小島。
而這個(gè)時(shí)候，天上出現(xiàn)一艘飛船，將閃電鳥給捉走，順便將小智他們也給抓走了！
而他們也見到了飛船的主人——吉爾露太，火焰鳥也被吉太給抓走。
原來(lái)這個(gè)吉爾露太是收藏家，他為了實(shí)現(xiàn)一則有關(guān)傳說(shuō)中的神奇寶貝的預(yù)言，想要捕獲火焰鳥、閃電鳥和急凍鳥以最終捕捉到“海之神”洛奇亞。
吉爾露太乘坐飛船已經(jīng)成功捕捉了火焰鳥，現(xiàn)在也抓到了閃電鳥，所以他現(xiàn)在就想要抓住急凍鳥。
但三聖鳥為了平衡勢(shì)力範(fàn)圍引起了世界範(fàn)圍內(nèi)氣候的崩潰，導(dǎo)致了全球範(fàn)圍內(nèi)災(zāi)難天氣的出現(xiàn)。
......
【禦龍渡：又是這樣的人，為了自己的一己私欲，居然打破了三聖鳥的平衡。】
【希巴：比阪木鬧出的動(dòng)靜還要大。】
【阪木：嫌我?guī)值氖虑橛绊懶∈前桑俏铱梢钥紤]一下幹一票大的！】
【禦龍渡：別讓我抓到你！】
【大木博士：還好是被選中的指揮者是小智，不然還真難說(shuō)。】
......
小智一行人就將火焰鳥跟閃電鳥放出來(lái)，飛船經(jīng)過了火焰鳥跟閃電鳥的破壞，墜落了下來(lái)。
就因?yàn)檫@樣意外地喚醒了洛奇亞。
火焰鳥、閃電鳥和急凍鳥同時(shí)內(nèi)鬥起來(lái)，都想要將對(duì)方給打敗。
小智一行人脫困的時(shí)候，撿到了閃電鳥的寶物，這個(gè)時(shí)候洛奇亞出手，將小智一行人帶迴了亞西亞島，他們還看到了河馬王看守的神廟。
洛奇亞想要?jiǎng)窦艿模蝗}鳥給壓製住。
所以隻有小智出手。
洛奇亞通過心靈感應(yīng)，給與小智幫助，助力小智拿迴那急凍鳥的寶物。
火箭隊(duì)也站了出來(lái)幫助小智，就為了拯救世界，繼續(xù)做壞人。
有了火箭隊(duì)的幫助，小智很快拿到了寶物，另外逃跑的時(shí)候，他們?yōu)榱瞬煌厢嵬龋暨M(jìn)海裏。
.......
【希巴：火箭隊(duì)真的，我哭死，危險(xiǎn)時(shí)刻居然站了出來(lái)！】
【禦龍渡：他們?nèi)齻�(gè)倒不太像是火箭隊(duì)，關(guān)鍵時(shí)候還是會(huì)分輕重的。】
【大葉：見了挺多壞人的，但這麼有特性的壞人還是頭一次見！】
“他們?nèi)齻�(gè)......”
阪木看著白光幕裏麵的火箭隊(duì)三人組，無(wú)奈一笑。
“這樣的感覺好爽啊！”
看到那麼多人都稱讚他們，火箭隊(duì)三人組頭一次感到這麼開心。