白世界——
小智在結束了又一段充滿挑戰與冒險的旅程後，滿載著迴憶與收獲，迴到了他熟悉而溫馨的真新鎮。
迴來沒多久，就聽到了小茂要離開真新鎮的消息。
從大木博士那得知小茂隻帶走水箭龜，而其他的寶可夢則都留在了研究所後院。
出於對好友的關心和不舍，小智趕忙過去送行。
小茂表示想要知道多一些關於寶可夢的事情，所以才這麼迫不及待地要離開真新鎮。
為了表達自己對小茂的支持和祝福，小智從口袋裏掏出了一個特別的禮物——半個精靈球，送給了小茂。
小茂離開後，小智跟皮卡丘坐在樹枝上，意外地看到了鳳王飛過。
......
【希巴：來了嗎？小智要跟鳳王對戰了？】
【奇巴納：真的又遇到了鳳王了！】
.......
眾人都在期待小智跟鳳王的戰鬥，但小智沒有像眾人所設想的那樣，熱血沸騰地與鳳王展開激戰，而是靜靜地站起身，目光深邃地注視著鳳王逐漸遠去的背影。
鳳王那優雅而莊嚴的飛翔姿態，如同在天空中勾勒出一幅壯麗的畫卷。小智從鳳王離去的軌跡中，那是前往豐緣地區的方向。
這個發現讓小智的心中湧起了一股莫名的激動，他對豐緣地區充滿了無盡的好奇與向往。
而小智也在這個時候想起了葉越，他是從豐源地區過來的，正好自己可以到豐緣地區旅行。
現在小茂都找到了自己的目標繼續旅行，他現在也有了下一個繼續旅行的目標。
晚上，小智便向大木博士等人說了自己的目標，要去豐緣這個地區旅行。
花子也知道小智的性子，也理解他對寶可夢的熱愛。她默默地為小智收拾好了行李，甚至連前往豐緣的船票都為他準備好了。
大木博士也將豐緣地區的寶可夢圖鑒交給了小智。
路上，小智帶皮卡丘坐前往豐緣地區的遊輪，而火箭隊三人組也跟到了遊輪上，趁小智不注意的時候抓走了皮卡丘，隻是路上出了點意外，喵喵意外地和皮卡丘來到了一座城鎮裏的倉庫。
皮卡丘跟喵喵遇到了一群寶可夢，它們被一群鬼斯通給欺負，霸占了它們的領地，皮卡丘趕跑了鬼斯通，那些寶可夢們就想皮卡丘留下來當它們的老大。
但這個時候火箭隊的武藏跟小次郎抓走皮卡丘，那些小拉達、比雕出手救下了皮卡丘，被趕走的鬼斯通也過來幫助皮卡丘，經過皮卡丘的調解和火箭隊三人組的“助攻”，小拉達們和鬼斯通們終於和好。
經過比雕的幫助，小智趕上了船，終於是來到了豐緣地區。
.......
【科拿：火箭隊三人組可真堅持，從關東地區開始，跟了小智到橘子群島、城都地區，現在又跟小智到另一個地區，他們跟蹤小智比小智三人一起旅行的時間還要長！】
【小智：這個是真的，我現在到卡洛斯地區旅行，火箭隊三人組也跟了過來，跟狗皮膏藥一樣甩都甩不掉，還一直對我的皮卡丘念念不忘。】
【小次郎：不止呢，在沒有抓到皮卡丘時，我們都會一直跟著你的，畢竟都跟了你幾個地區了，要是就這麼放棄了，那我們之前的努力不就白費了嗎？那我們之前受的苦，經常被皮卡丘電算什麼？】
【小智：算...你們罪有應得！】
【小遙：哈哈哈，小智說得對！】
【武藏：臭小鬼頭...你就現在開心開心吧，別給我們找到機會抓走皮卡丘。】
對於火箭隊三人組的威脅，現在不止是小智一行人不放在心上，就連觀影的眾人都不把他們放在眼裏。
雖說他們三個家夥是火箭隊的，而且喵喵還很奇特會說話，但戰鬥力太低，完全不是小智一行人的對手。
初次見麵的時候，以為火箭隊三人組很厲害，到了後麵，他們不再僅僅是單純的反派，而是更多地以一種搞笑藝人的身份出現，經常在關鍵時刻“助攻”小智一行人，幫助他們解決難題或逃脫困境。
【小智：旅行的時候都要時刻注意火箭隊，稍不留神就會被火箭隊給抓走皮卡丘，還挺煩的。】
【小次郎：你把皮卡丘給我們，就再也不用怕煩了，這樣對你我都好，一舉兩得！】
【武藏：就是就是！！！】
【小智：我是木訥，不是傻子！】
嘿嘿，答不答應，我們都是要抓走皮卡丘的.......
火箭隊三人組互相對視一眼，心中的目標一致，從未改變過。
......
白世界——
皮卡丘受到了火箭隊三人組用電磁吸收電力的方式，身體狀態變得很虛弱，還發燒了。
小智就帶皮卡丘尋求治療，但鎮上沒有寶可夢中心，隻好聯係了小田卷博士。
但皮卡丘身上的電力太強，體內殘餘的電力竟然與研究所內的設備發生了劇烈的反應，直接導致了一場小規模的爆炸。受到驚嚇的皮卡丘趁機逃出了研究所，它的體力已經達到了極限，電力在體內肆虐，幾乎要失控。
皮卡丘踉蹌著來到了一個懸崖邊。身體的痛苦和精神的折磨讓它幾乎失去了理智，想要跳下懸崖，但小智毫不猶豫地跟著跳了下去，一隻手抱住皮卡丘，另一隻手緊緊抓住了懸崖邊的樹枝，用盡全力穩住了身形。
可真強......眾人看到小智為了保護皮卡丘，不惜冒著生命危險跳下懸崖，心中充滿了敬佩和震撼。他們都不知道有沒有跳下去救寶可夢這個勇氣，跟小智沒法比，小智經常奮不顧身地保護寶可夢，他們看得也是很激動。
替皮卡丘高興，找到了這麼好的訓練家！
小田卷博士跟小遙過來幫助小智，將他們拉了上來。
這個時候，火箭隊三人組又來‘助攻’，用了電池機器人及時吸收皮卡丘電力。
皮卡丘身上的電力將火箭隊的電池機器人給塞滿，直接炸開。皮卡丘多餘的電力被吸走而脫離了危險是好事，但小遙的自行車也因此被皮卡丘的電擊給毀壞。
......
【小剛：又是小智，又是皮卡丘，又是火箭隊...又貢獻了一輛自行車！】
【馬誌士：曆史總是驚人地相似......常磐市的寶可夢中心那也毀了一輛自行車，現在到新地區旅行，居然又毀了一輛自行車，皮卡丘都可以說是自行車殺手！】
【小智：那都是意外啦！】
“額，都是一樣因為皮卡丘將自行車毀了才認識小智的。”
看到白光幕裏邊，自己跟小智第一次見麵的場地，自行車就遭此大劫......小遙有些慶幸，要是自行車不壞，說不定她會錯過小智呢。
現在小智不在身邊沒關係，通過這個光幕播放出來，那麼小智應該會明白自己心意了吧。
......
迴到了研究所，小遙選擇了自己的初始寶可夢火稚雞。
自己的自行車因為意外被毀壞，所以跟小智一起同行到古玫鎮的寶可夢中心辦理豐緣地區旅行的登記。